理化分析室由原浙江医科大学中心实验室和原浙江农业大学中心实验室化学室合并组建而成。在医药分析化学、农业环境化学、农药化学等领域已有30多年的工作基础。其服务宗旨是在农业生物学、环境科学、动物科学、食品科学、医药学、化工化学等领域，为校内外提供一个先进的仪器分析平台，为各院系、研究所及校外各院校、企事业单位提供光谱、色谱、质谱分析测试服务及技术咨询。实验室始终把为学校教学科研提供一流服务放在首位，同时为社会服务，出具计量认证检测报告，“科学、公正、准确、可靠”是实验室恪守的工作方针。2012年与食品学科共建成为“农业部农产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室”。同时还是司法部浙江大学司法鉴定中心的组成成员，为司法鉴定提供检测数据。
    实验室以色质谱为主要分析手段，结合光谱分析、化学分析和样品分离纯化技术，开展生物活性成分分析、安全农产品分析、食品营养成分分析、农药残留及环境污染物分析、药物及制剂分析等，分析测试对象为小分子化合物的各种理化数据，包括无机物的定性定量分析，有机小分子的定性定量分析，测试的目标包括有效成分含量和有害成分的限度。目前实验室已拥有超高效液相-三重四极杆飞行时间质谱联用仪（Q-TOF）、快速液相-三重串联四极杆质谱联用仪、气相色谱三重四极杆质谱联用仪、液相色谱-电感耦合等离子体质谱仪、超高效液相色谱仪、高效液相色谱仪、气相色谱仪、毛细管电泳仪、红外光谱仪、紫外分光光度计、荧光分光光度计等大中型分析仪器以及样品前处理设备。实验室开展分析方法学研究与制订，提供研究生上机操作培训，对其建立的分析方法科学性和可靠性进行指导。分析测试服务范围包括以下几个方面：
1. 农产品、水产品安全性检测以及检测方法研究，包括非法添加剂、农药残留量、抗生素、激素残留量等。
2. 环境（土壤、空气、水）中有害物质检测，包括挥发性、不挥发性有机污染物、重金属残留量等。
3. 农产品中营养物质分析，食用及药用植物活性成分分析。
4. 药物的质量标准研究与制订及体内药物分析。