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Ion Reporter 分析系统
操作规程
 


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型号规格   Ion Reporter 管理员   毛伟华,高其康
英文名字   Ion Reporter System 联系电话   0571-88982672
生产厂家   美国Life Technologies公司 E-mail   [email protected]
放置地点   紫金港校区农生环大楼C816 仪器状态   运行中
启用日期   2017年9月 浏览次数   1271
收费标准
技术参数
1. 机器容量大于等于二元8核 2.9GHZ CPU;
2. 内存大于等于 128GB;
3. 配备2X NVDIA Tesla GPUS(图形处理器);
4. 硬盘大于等于 27TB可用存储;
5. 配备 Ubuntu 10.04 操作系统。
主要功能
1. Ion Reporter™是专门为开展常规测序分析的研究人员而设计,能简化Ion torrent测序平台测序数据的分析、注释和存档,从而协助突破生物信息学的障碍。能与Torrent Suite软件的无缝整合实现了自动的数据转移和分析。
2. 该系统整合了生物信息学分析,内置多种Ampliseq数据分析流程,不仅能够对单个样本进行生物学功能注释,而且能够完成对双样本或三样本的比较分析并自动生成报告。注释包含基因区域、遗传密码子变化、氨基酸变化、GO注释、药物靶点分析等。
3. Ingenuity® Variant Analysis™流程适合外显子组发现-整合的解决方案,实现了生物学分析和解释,以便快速确定最引人注目的变异,用于人类重测序研究的后续分析。
应用范围  
寻找样品基因组与参考基因组之间的差异,探索多个样品中变异之间的差异,比较肿瘤样品、生殖细胞系样品之间的变异,进行遗传病的家系分析等。