型号规格

Ion torrent Proton，Ion torrent PGM

管理员

毛伟华、吴三玲、高其康

英文名字

High-throughput Sequencing System

联系电话

0571-88982672；88982077

生产厂家

美国Life Technologies公司

E-mail

[email protected]

放置地点

紫金港校区农生环大楼C座816

仪器状态

运行中

启用日期

2014年3月

浏览次数

1300

收费标准

技术参数

Ion Proton：
1. PI芯片每反应的有效数据≥10G；
2. 单端读取序列长度覆盖范围可达到200 bp；
3. 可在2-3小时内完成多至200 bp长度的测序任务；
4. 读长及其准确性：原始数据准确性≥99.5％，共有序列一致准确性≥99.99%；
5. 可进行多样本混合样本检测和独立样品分析；
6. 完整的数据分析软件：包含原配的未知基因序列的自动拼接软件、已知序列的自动序列比对、自动SNP位点、拷贝数、突变的查找等功能，配套生物信息学分析体系。
7. 数据存储空间较大，需要数据存储用磁盘阵列和离线数据分析能力。
Ion PGMTM：
1. 314、316和318三种芯片，每反应的有效数据分别为≥10M、100M、1G；
2. 单端读取序列长度覆盖范围可达到400 bp；
3. 可在3小时内完成多至400 bp长度的测序任务；
4. 读长及其准确性：原始数据准确性≥99.5％，共有序列一致准确性≥99.99%；
5. 可进行多样本混合样本检测和独立样品分析；
6. 完整的数据分析软件：包含原配的未知基因序列的自动拼接软件、已知序列的自动序列比对、自动SNP位点、拷贝数、突变的查找等功能，配套生物信息学分析体系；
7. 数据存储空间较大，需要数据存储用磁盘阵列和离线数据分析能力。

主要功能

实现核酸快速测序／拼接、快速分析，这些核酸包括基因组DNA、RNA、mRNA、microRNA和宏基因组DNA等，分析包括预测、表达量、多态性等，快速实现以下应用。
1. 环境微生物宏基因组测序；
2. 染色质免疫互沉淀测序；
3. 全自动肿瘤学研究分析；
4. 动植物基因组测序；
5. 外显子组测序分析；
6. 转录组测序；
7. 靶向基因测序。

应用范围

涉及与基因研究相关的所有学科，包括生物学，医学、农学、生物类基础学科、药学等。